Clusters de recherche

Le labEx INRT est un des projets phare et ambitieux de l'IGBMC, qui explore les mécanismes de régulation de l’expression des gènes dans le développement, la physiologie, et diverses pathologies humaines autour de trois grand domaines de recherche prioritaire :  i) l’étude de l’assemblage et de la structure de diverses machineries de manière spatio-temporelle impliqués dans la coordination de l'expression des gènes, ii) la caractérisation des interactions entre les réseaux de régulation des gènes et les voies de signalisation qui contrôlent dans le temps et l'espace l’identité et la spécialisation des cellules, et leur impact sur la formation des organes et iii) la mise en évidence des dérégulations de ces processus qui conduisent à des pathologies humaines. S'appuyant sur les forces des départements scientifiques de l'IGBMC et sur ses domaines de recherche scientifique émergents, le LabEx INRT s'engage à relever des défis majeurs dans les domaines de la dynamique nucléaire et de l'épigénétique, de la médecine régénérative et translationnelle, et de la biologie quantitative des systèmes. Un nouvel axe de recherche transverse sur la biologie computationnelle sera renforcé afin d'intégrer des données provenant de systèmes biologiques étudiés pour modéliser des réseaux complexes de régulation et générer des modèles prédictifs expliquant le comportement de systèmes complexes en physiologie et en pathologie.

LabEx HepSYS est constitué d'une équipe réunissant des scientifiques en biologie moléculaire et cellulaire hautement qualifiés, des bioinformaticiens, des hépatologues et des chirurgiens des pathologies hépatiques de l'Institut des Maladies Virales et Hépatiques (Université de Strasbourg, Inserm U1110), et du CHU de Strasbourg (HUS). L'un des points forts du LabEx HepSYS est un continuum de la recherche fondamentale à la recherche translationnelle et clinique, ainsi que l'établissement de solides collaborations et de réseaux d'excellence avec des experts de premier plan du domaine au niveau local et international. Depuis sa création en 2011, HepSYS a apporté des contributions majeures dans la compréhension de la pathogenèse virale et métabolique des maladies du foie et leur traduction en applications cliniques, y compris le développement de nouvelles méthodes préventives et thérapeutiques. Les principaux objectifs d'HepSYS sont (1) de décrypter les circuits cellulaires à l'origine de la progression de la maladie du foie, (2) de développer des modèles innovants dérivés des patients pour la maladie du foie, (3) de caractériser les interactions SARS-CoV-2 / HBV / HCV / HDV – hépatocytes, et (4) de traduire les découvertes en nouvelles stratégies thérapeutiques. En fournissant une nouvelle compréhension de la biologie des maladies du foie et en découvrant de nouvelles cibles et biomarqueurs, le programme HepSYS vise à améliorer la prise en charge des patients atteints de maladie du foie et de cancer du foie en France, en Europe et au-delà.

Le LabEx MitoCross regroupe six équipes de renommée internationale hébergées par deux Instituts strasbourgeois (GMGM, IBMP), spécialistes des mitochondries. Le projet MitoCross se décline en quatre axes principaux visant à décrire la diversité évolutive des systèmes mitochondriaux, leurs machines macromoléculaires, les mécanismes du trafic intracellulaire impliquant les mitochondries, et l'application des connaissances acquises pour mieux comprendre les dysfonctionnements mitochondriaux et les corriger. Un accent particulier sera mis sur l'innovation méthodologique, l'élaboration et l'exploitation de nouveaux outils. MitoCross offre une concentration locale sans précédent d'expertise interdisciplinaire couvrant la plupart des domaines de recherche liés aux mitochondries, englobant de nombreux modèles biologiques (champignons, organismes photosynthétiques, mammifères y compris l'Homme) et une large panoplie de technologies (biochimie, biologie moléculaire et structurale, biologie cellulaire, biomédecine, génétique et bioinformatique).

Le consortium NetRNA regroupe 11 équipes de renommée internationale issues de deux instituts de recherche interdisciplinaire d’excellence (IBMC, IBMP). NetRNA vise à élucider les stratégies basées sur l'ARN qui ont co-évolué chez les agents pathogènes et leurs hôtes, en particulier pour moduler la détection et la clairance des agents pathogènes par le système immunitaire de l'hôte. Les équipes étudient les rôles des machineries ARN dans la communication intercellulaire, dans la physiologie et le comportement des agents pathogènes pendant l'infection, dans la détection et la neutralisation des acides nucléiques non-soi, et dans la modulation de l'interaction des agents pathogènes avec leurs hôtes et les insectes vecteurs. Les processus fondamentaux sont examinés en détail, notamment la régulation épigénétique, l'intégrité du génome, la transcription, la traduction, la dégradation de l'ARN, les modifications de l'ARN et des protéines. L'étude comparative d'organismes modèles (insectes, plantes, cellules humaines) et de divers pathogènes (i.e., bactéries, parasites et virus) abordera les spécificités et les traits communs de chaque système pathologique. Les ARN sont également exploités pour des applications en biotechnologie, médicales et agronomiques.